Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms