Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GSDMCQ9BYG8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GSDMCQ9BYG8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms