Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF17Q9BXT8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms