Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms