Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRRC61Q9BV99 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRC61Q9BV99 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms