Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOXF2Q9BQY4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms