Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIK3R4Q99570 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms