Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PKP4Q99569 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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PKP4Q99569 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PKP4Q99569 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PKP4Q99569 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKP4Q99569 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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