Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2BQ99453 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms