Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT15Q96T59 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms