Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBL7Q96S82 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms