Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT140Q96RY7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms