Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDC1Q96MU7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms