Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SENP8Q96LD8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms