Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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