Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRG4Q92954 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms