Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf43Q8TAL5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms