Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms