Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP34Q70CQ2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP34Q70CQ2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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