Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG16L1Q676U5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms