Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM164Q5U3C3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms