Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A3Q5K4L6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms