Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms