Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPHKAPQ2M3C7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
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