Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ISXQ2M1V0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 541.7 ms