Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms