Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDO1Q16878 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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