Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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