Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NDUFA9Q16795 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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NDUFA9Q16795 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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NDUFA9Q16795 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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NDUFA9Q16795 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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NDUFA9Q16795 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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NDUFA9Q16795 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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NDUFA9Q16795 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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NDUFA9Q16795 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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NDUFA9Q16795 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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NDUFA9Q16795 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA9Q16795 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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