Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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LAMA3Q16787 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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