Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VPS72Q15906 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VPS72Q15906 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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