Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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