Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPTX1Q15818 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPTX1Q15818 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPTX1Q15818 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPTX1Q15818 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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NPTX1Q15818 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPTX1Q15818 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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NPTX1Q15818 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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NPTX1Q15818 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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NPTX1Q15818 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPTX1Q15818 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
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