Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TCEA2Q15560 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms