Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCM1Q15154 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms