Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRD3Q15059 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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BRD3Q15059 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BRD3Q15059 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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