Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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GBX1Q14549 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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GBX1Q14549 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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GBX1Q14549 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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GBX1Q14549 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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