Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOFQ13790 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOFQ13790 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOFQ13790 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOFQ13790 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOFQ13790 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms