Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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NCOA4Q13772 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCOA4Q13772 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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