Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CACNA1SQ13698 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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