Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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CDH18Q13634 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CDH18Q13634 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CDH18Q13634 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CDH18Q13634 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CDH18Q13634 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CDH18Q13634 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CDH18Q13634 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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