Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms