Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms