Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HDAC1Q13547 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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