Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BFSP2Q13515 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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