Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SKP2Q13309 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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