Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM2Q13029 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM2Q13029 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
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