Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PTP4A2Q12974 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTP4A2Q12974 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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