Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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