Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SREBF2Q12772 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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